Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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