Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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