Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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