Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms