Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.81
NME3Q13232 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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NME3Q13232 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
NME3Q13232 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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NME3Q13232 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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NME3Q13232 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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NME3Q13232 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NME3Q13232 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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