Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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