Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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