Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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