Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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FXNQ16595 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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FXNQ16595 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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FXNQ16595 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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FXNQ16595 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FXNQ16595 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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