Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms