Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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