Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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