Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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MKRN4PQ13434 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
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MKRN4PQ13434 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
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MKRN4PQ13434 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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MKRN4PQ13434 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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MKRN4PQ13434 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
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