Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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TCOF1Q13428 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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TCOF1Q13428 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TCOF1Q13428 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
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