Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SALL3Q9BXA9 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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