Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms