Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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RFTN1Q14699 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
RFTN1Q14699 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
RFTN1Q14699 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RFTN1Q14699 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RFTN1Q14699 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RFTN1Q14699 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RFTN1Q14699 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RFTN1Q14699 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RFTN1Q14699 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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