Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms