Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms