Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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