Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F1Q01094 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms