Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ATMINO43313 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ATMINO43313 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ATMINO43313 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ATMINO43313 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ATMINO43313 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ATMINO43313 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ATMINO43313 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ATMINO43313 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms