Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP35Q9P2H5 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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