Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SP140Q13342 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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SP140Q13342 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SP140Q13342 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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