Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTPN13Q12923 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTPN13Q12923 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTPN13Q12923 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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