Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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