Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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