Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSC4Q9Y5U2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms