Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms