Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms