Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms