Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHANK2Q9UPX8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms