Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF8Q9UPN6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms