Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNRGQ9UMZ2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms