Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPO2Q9UMS6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms