Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNRF3Q9ULT6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms