Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms