Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms