Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms