Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCTN4Q9UJW0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms