Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG3Q9UJ98 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms