Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF20Q9UGU0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms