Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms