Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT172Q9UG01 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT172Q9UG01 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms