Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms