Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms