Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS7AQ9UBW8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS7AQ9UBW8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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