Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms