Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms