Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SALL1Q9NSC2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms